Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DEFA6Q01524 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms