Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CLDN9O95484 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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