Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms