Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms