Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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