Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms