Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms