Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL596188.1-201ENST00000452888 370 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC00929-205ENST00000557672 514 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
IDH3AP50213 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms