Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
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