Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KLRC1-207ENST00000544822 1600 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R65P-201ENST00000566443 808 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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TIMMDC1Q9NPL8 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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