Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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