Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms