Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USF2Q15853 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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