Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PAPPA2-201ENST00000367661 4369 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms