Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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