Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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