Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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