Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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