Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CENPFP49454 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CENPFP49454 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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