Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC02330-201ENST00000557784 555 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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