Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC012370.2-202ENST00000600508 1099 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
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NCOA4Q13772 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
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