Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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