Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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