Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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