Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms