Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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GOPCQ9HD26 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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GOPCQ9HD26 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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GOPCQ9HD26 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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GOPCQ9HD26 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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GOPCQ9HD26 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GOPCQ9HD26 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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