Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01854-201ENST00000375987 2213 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00243-201ENST00000399196 2052 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ENTHD1-201ENST00000325157 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RALYL-205ENST00000521268 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-201ENST00000354897 1754 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms