Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms