Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms