Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL139274.1-201ENST00000402374 936 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P8-201ENST00000455120 874 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC068042.1-201ENST00000482222 1148 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms