Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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