Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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