Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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HOXA13P31271 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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