Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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