Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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