Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms