Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
COL24A1Q17RW2 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms