Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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GRIK4Q16099 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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