Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms