Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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