Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms