Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
LTBRP36941 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
LTBRP36941 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LTBRP36941 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LTBRP36941 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LTBRP36941 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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LTBRP36941 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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