Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms