Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms