Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LRRTM2O43300 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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