Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A4Q9Y6R1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms