Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF330Q9Y3S2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms