Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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