Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms