Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF5Q9Y2D1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms